2006年3月，將梅溪鄉(xiāng)的齊石、分水垅、白石嶺、金鳳橋、監(jiān)申橋、梅子市等6個行政村劃歸經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)管轄。將岳陽經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)的站前路街道辦事處整體劃入岳陽樓區(qū)，設(shè)德勝、鐵路、西瓜山、望城嶺、新站等5個社區(qū)居委會。另有5個街道辦事處分別增設(shè)1個社區(qū)居委會，其中岳陽樓街道辦事處增設(shè)北門居委會，三眼橋街道辦事處增設(shè)尚書山居委會，洛王街道辦事處增設(shè)雷鋒山居委會、冷水鋪街道辦事處增設(shè)長動社區(qū)居委會。居委會增加到87個，行政村減至15個。12月18日，將區(qū)住房公積金管理中心并入市住房公積金管理中心，收歸市管。

　　2007年7月，進(jìn)行自建區(qū)以來規(guī)模最大的一次區(qū)劃調(diào)整，涉及到全區(qū)所有的鄉(xiāng)、街道辦事處。新增街道辦事處1個，更名街道辦事處3個。區(qū)劃調(diào)整后，城陵磯街道辦事轄6個社區(qū)、1個行政村；梅溪鄉(xiāng)轄5個行政村、4個社區(qū)；冷水鋪街道辦事處更名為望岳路街道辦事處，轄5個社區(qū)；洞庭街道辦事處轄5個社區(qū)；岳陽樓街道辦事處轄7個社區(qū)；呂仙亭街道辦事處轄8個社區(qū)；東茅嶺街道辦事處轄6個社區(qū)；金鶚山街道辦事處轄10個社區(qū)；新路口街道辦事處更名為楓橋湖街道辦事處；轄6個社區(qū)；站前路街道辦事處轄區(qū)5個社區(qū)；五里牌街道辦事處轄7個社區(qū)；三眼橋街道辦事處轄7個社區(qū)；洛王街道辦事處轄6個社區(qū)；新成立的王家河街道辦事處轄5個社區(qū)；北港街道辦事處更名為奇家?guī)X街道辦事處，轄5個社區(qū)、1個行政村；郭鎮(zhèn)鄉(xiāng)調(diào)整后轄8個行政村。街道辦事處由2006年的13個增至14個。社區(qū)居委會由2006年的87個增至93個，行政鄉(xiāng)和行政村數(shù)量未變。

　　2008年，全區(qū)共有行政鄉(xiāng)2個、街道辦事處14個；行政村15個、居委會93個。

　　2009年，增加4個副科級行政支持類事業(yè)單位，其中升格2個、新設(shè)2個；更名1個正科級行政支持類事業(yè)單位。4月，原岳陽樓區(qū)新型農(nóng)村合作醫(yī)療管理辦公室由正股級升格為副科級；7月，原岳陽樓區(qū)城市居民個最低生活保障中心由正股級升格為副科級，并更名為岳陽樓區(qū)社會救助管理局；8月，正是發(fā)文成立岳陽樓區(qū)控建拆違工作辦公室；11月，成立岳陽樓區(qū)市容環(huán)境衛(wèi)生管理局。7月，原岳陽樓區(qū)農(nóng)村經(jīng)營管理中心更名為岳陽樓區(qū)經(jīng)營管理局。3月，新成立呂仙亭街道辦事處三角線社區(qū)。至年底，全區(qū)行政鄉(xiāng)、街道辦事處和行政村數(shù)量未變，社區(qū)居委會增加到94個。

　　2010年6月，成立岳陽樓區(qū)城市建設(shè)投資管理中心，加掛岳陽樓區(qū)城市建設(shè)投資責(zé)任有限公司牌子，為正科級行政支持類事業(yè)單位。5月和8月，先后成立金顎山街道辦事處重湖社區(qū)、五里牌街道辦事處運通街社區(qū)。至年底，全區(qū)社區(qū)居委會由原來的94個增加到96個，行政鄉(xiāng)、街道辦事處和行政村數(shù)量未變 。